Préfecture de Lot-et-Garonne, Agen vit d'une économie agricole et agroalimentaire marquée par le pruneau, les fruits et les légumes du Sud-Ouest, complétée par un site pharmaceutique historique, UPSA. Les services publics pèsent lourd, notamment avec l'ENAP qui forme les personnels pénitentiaires. Les PME locales sont souvent des coopératives, des conditionneurs ou des négociants, avec de fortes saisonnalités de production et d'expédition.
Le campus agenais accueille des formations rattachées à l'Université de Bordeaux, des BTS et l'ENAP pour les métiers pénitentiaires. Les compétences en développement d’applications web restent limitées sur place ; le vivier toulousain et bordelais est à environ une heure.