Siège de la Collectivité de Corse et préfecture de région, Ajaccio a une économie dominée par l'administration, la santé, le commerce et le tourisme. La saisonnalité est marquée : la population présente et l'activité hôtelière augmentent fortement l'été. Le tissu privé se compose de très petites entreprises et de PME, dans le BTP, la distribution et les services, avec des contraintes logistiques propres à l'insularité, comme l'approvisionnement par bateau.
L'Università di Corsica, basée à Corte, forme des diplômés en informatique et en gestion, dont une partie s'installe à Ajaccio. Le vivier reste restreint et les profils seniors se recrutent souvent sur le continent ou en travail à distance.